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樟树抗病基因家族生物信息学解析
来源:    作者:汪信东等    时间:2023-11-06 16:50    点击数:
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完成单位:云开体育app官网入口网页版(中国)有限公司

完成人员:汪信东等

成果简介:本研究基于樟树全基因组草图数据和五种化学类转录组数据开展,通过全基因组比对(BLAST)和隐马尔可夫模型(hmmer3.0)对樟树基因组中全部R基因进行结构域注释,结合人工矫正获得了全部R基因开放阅读框(ORF)。据统计,樟树基因组中总计有229个R基因位点,包含150个完整序列和79个“假基因”,可分为8种结构类型。克隆了2个抗白粉病类似R基因、分别名命为CNR1和CNR2,通过烟草瞬时表达系统显示二者都具有自激活现象,发表论文2篇。

成果评价:云开体育app官网入口网页版(中国)有限公司组织验收


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